Elektronická kniha může být vydána v různých formátech. Mezi nejtypičtější patří ePUB a MOBI, které zachovávají sazbu knihy i při změně velikosti písma. Rozšířeným formátem je i PDF, v němž se publikuje většina dokumentů na počítači. Čím více typů souborů čtečka podporuje, tím širší bude možnost použití.
