Tolerance průměru udává, jak moc se skutečná tloušťka tiskové struny, tedy filamentu, může lišit od jejího udávaného standardního průměru, který je nejčastěji 1,75 mm nebo 2,85 mm. Hodnota tolerance se značí jako plus/mínus, například „±0,05 mm“. To v praxi znamená, že filament s průměrem 1,75 mm bude mít ve skutečnosti tloušťku v rozmezí od 1,70 mm do 1,80 mm. 3D tiskárna je nastavena tak, aby podávala materiál do trysky na základě předpokladu, že má filament po celé své délce konstantní průměr. Pokud se tloušťka struny mění, kolísá i množství vytlačovaného materiálu. V místě, kde je filament tlustší, tiskárna vytlačí materiálu více, což může vést k tvorbě hrbolků a nepřesností na povrchu výtisku. Naopak v místě, kde je filament tenčí, se vytlačí materiálu méně, což způsobuje mezery mezi vrstvami, slabou soudržnost a celkově křehčí model. Menší hodnota tolerance, například „±0,02 mm“, proto značí stálejší průměr filamentu, což zajišťuje rovnoměrnější tok materiálu a vede k rozměrově přesnějším a hladším výtiskům.
